概述

      民國四十五年七月中央為適應戰時需要，統一戰地軍政指揮，實施金 門、馬祖地區「戰地政務實驗辦法」，令本府移駐臺灣，負責研究有 關收復福建地區之重建計畫方案及對大陸福建地區廣播、閩僑聯繫、 人才儲備與不屬戰地政務之一般省政工作。

      民國八十一年十一月七日金馬地區戰地政務終止，實施地方自治，金 門、連江縣回歸民主憲政，本府奉命於八十五年元月十五日從臺北新 店遷回金門辦公。

本府願景理念

【建設金馬 開創和平】

      強化建設，繁榮經濟；促進交流，共創和平。

一、 落實民生經建 奠定永續發展根基

      協助金、連兩縣落實交通運輸、醫療衛生、教育文化、農林漁牧、水 電等民生基礎建設，以奠定永續發展之根基。

二、發展經貿事業 提昇民眾生活水準

      發展觀光事業，繁榮地方經濟，推動產業文化，促進農漁業轉型升級 ，創造就業機會，提升民眾生活水準，縮短本、離島差距。

三、整合醫療體系 改善民眾醫療問題

      協助整合醫療體系，提升醫療品質，以解決離島 之醫療問題。

四、加強生態保育 營建綠色海上公園

      加強自然生態保育，強化植樹保林，鼓勵環境整理及綠美化工作，營 造零污染之清淨家園，永保好山好水之海上公園。

五、促進兩岸通航 增進金馬人民生機

      促進兩岸小三通正常化，建請法規鬆綁，減少限制，簡化手續，以開創 金馬生機。

六、終止兩岸敵對 開創海峽和平地區

      推動金馬成為兩岸終止敵對之緩衝區，增加交流，促進瞭解，進而成 為兩岸和平地區，使金、馬對兩岸和平做出偉大的貢獻。

歷任主席

第7任胡璉（1949年11月23日-1955年元月）

第8任戴仲玉（1955年2月-1986年5月）

第9任吳金贊（1986年6月-1998年2月）

第10任顏忠誠（1998年2月-2007年5月）

代理主席楊誠璽（2007年5月21日-2007年11月28日；以省政府第一組組長兼任代理省主席）

第11任陳景峻（2007年11月28日-2008年5月20日；以行政院秘書長兼任福建省主席）

第12任薛香川（2008年5月20日-2009年9月10日；以行政院秘書長兼任福建省主席）

第13任薛承泰（2009年9月10日-迄今；以行政院政務委員兼任福建省主席）